新软件有望实现肿瘤标志物高效筛查
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央广网北京4月12日消息肿瘤标志物对肿瘤早期诊断、治疗与预后分析等有重要临床意义。糖基化蛋白质是常见的标志物之一，临床上检测蛋白质或糖抗原的浓度，存在灵敏度低、假阳性高的问题。位点特异性糖型反映了特定糖型在蛋白质特定位点的修饰，是一类非常有潜力的新型标志物。但由于位点特异性糖型分析技术困难，目前临床上还未普遍使用。
近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员叶明亮团队开发出一款具有高灵敏度的N-糖肽质谱谱图解析新软件——Glyco-Decipher。该软件可在不依赖糖库情况下，进行肽段序列鉴定，实现未知糖链肽段及其上可能带有的修饰基团的鉴定，提高了完整糖肽的解析率，实现了位点特异性糖型的高效鉴定。相关研究结果发表在《自然-通讯》上。
叶明亮介绍，N-糖肽质谱谱图解析率低的问题困扰着科研界，为解决这一问题，研究团队系统研究了糖肽的碎裂规律，发现糖链的种类、组成、母离子价态等对肽段骨架的碎裂模式没有显著的影响。
获取灵感后，研究团队利用不同糖肽同一肽段骨架具有相似碎裂规律的特点，建立了肽段序列相同的完整糖肽谱图之间的联系，发展出基于“模式识别”的肽段序列鉴定策略，实现了完整糖肽的谱图拓展，在原有基础上将完整糖肽的解析率提升了31%。
研究团队认为，Glyco-Decipher为深度解析位点特异性糖型，揭示糖基化修饰的微观不均一性，以及研究糖生物学功能等提供了新工具。
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